简介:
Bst DNA聚合酶是Bacillus stearothermophilus DNA聚合酶的一部分,具有很强的链置换活性,以及5’→3’的DNA聚合酶活性,因此可以应用于LAMP( Loop-mediated isothermal amplification)检测实验。
LAMP是一种新型核酸扩增技术,采用4或6条能够识别目的基因上的6个特异区域的引物,依赖与Bst DNA聚合酶的强链置换活性,在30~60分钟内DNA扩增可达109~1010倍。
在LAMP的高效反应过程中会产生大量的焦磷酸根离子,其与镁离子结合形成焦磷酸镁白色沉淀,因此在实验过程中可通过检测反应液的浊度变化进行实时定量检测。也可在反应结束后肉眼直接观察焦磷酸镁沉淀,根据是否形成白色沉淀来判断反应是否发生。
反应实例:
1. 按以下组分配置反应混合液
2×Turbidity LAMP Mix | 12.5μ |
10×LAMP Primer Mix | 2.5 μl |
5M Betain | 0~4μl |
模板DNA | Xμl |
Bst2.0 DNA Polymerase | 1 μl |
ddH2O | Up to 25μl |
2. 反应体系配好后,充分混匀并短暂离心,置于60~68°C进行反应,连接LAMP实时浊度仪,对浊度变化进行实时检测。也可肉眼分别于30min、45min、60min观察浊度变化。必要情况下85°C热失活5min(可选)。
LAMP实验的条件优化:
(1)10×LAMP Primer Mix配置
| 浓度 | 首次实验浓度 | 引物储液浓度 |
FIP | 8~16 μM | 8,12,16μM | 100μM |
BIP | 8~16 μM | 8,12,16μM | 100μM |
Loop F | 2~8μM | 2,4,8μM | 100μM |
Loop R | 2~8μM | 2,4,8μM | 100μM |
F3 | 0.5~2μM | 0.5,1,2μM | 100μM |
B3 | 0.5~2 μM | 0.5,1,2μM | 100μM |
(2)Betain使用浓度
测试浓度 | 5M Betain25μl体系添加量 |
0M | 0 μl |
0.25M | 1.25μl |
0.4M | 2μl |
0.6M | 3 μl |
0.8M | 4μl |
(3)Turbidity LAMP对照设置
| 颜色对照 | 阴性对照 | 实验样品 |
ddH2O | √ | √ | √ |
Turbidity LAMP Mix | √ | √ | √ |
LAMP Primer Mix | √ | √ | √ |
5M Betain | 可选 | 可选 | 可选 |
模板DNA | √ | ╳ | √ |
Bst2.0 | ╳ | √ | √ |
(4)反应温度设置
通常反应温度为65°C,由于引物的效率差异,可在60、63、65、68°C进行适当调整。首次实验建议采用60、65°C
注意事项:
(1). 为了减少交叉污染,请分区操作(试剂和模板DNA的配置操作最好在不同区域中进行)。
(2).实验时,所需模板量取决与样品类型(0.1ng~100ng),可先进行预实验确定模板量。
(3). 各区物品均为专用,不可交叉使用,防止污染。
(4). 实验过程中应穿工作服,带手套,建议使用带滤芯的一次性吸嘴。
储存:
-20℃可保存3年。