简介:
Bst DNA聚合酶是Bacillus stearothermophilus DNA聚合酶的一部分,具有很强的链置换活性,以及5’→3’的DNA聚合酶活性,因此可以应用于LAMP(Loop-mediated isothermal amplification)检测实验。该制品内含Bst4.0 DNA聚合酶因此既可以扩增DNA,也可以直接扩增RNA分子。
LAMP是一种新型核酸扩增技术,采用4或6条能够识别目的基因上的6个特异区域的引物,依赖与Bst DNA聚合酶的强链置换活性,在30~60分钟内DNA扩增可达109~1010倍。
在LAMP的高效反应过程中会产生大量的焦磷酸根离子,其与镁离子结合形成焦磷酸镁白色沉淀,因此在实验过程中可通过检测反应液的浊度变化进行实时定量检测。也可在反应结束后肉眼直接观察焦磷酸镁沉淀,根据是否形成白色沉淀来判断反应是否发生。
储存:
LAMP Lyophilized Turbidity Reagent为干粉形式,包含Bst 4.0 DNA聚合酶、dNTP等,在未溶解前,该制品可-20℃长期保存,并可室温运输,性能无下降。LAMP Lyophilized Turbidity Reagent使用前每瓶用750μl的LAMP Turbidity Buffer溶解后,可立即使用,剩余试剂可在-20℃保存1个月,在-60℃以下长期保存。
反应实例:
1. 按以下组分配置反应混合液
溶解后的LAMP Lyophilized Turbidity Reagent | 12.5μl |
LAMP Primer Mix | 1 or 1.5 or 2ul |
模板DNA or RNA | 1μl |
ddH2O | Up to 20μl |
首次实验时LAMP Primer Mix分别采用1、1.5、2μl 进行预实验。
2. 反应体系配好后,充分混匀并短暂离心,置于60~65°C进行反应(首次实验可采用60℃),连接LAMP实时浊度仪,对浊度变化进行实时检测。也可肉眼分别于20min、25min、30min、45min观察浊度变化。
LAMP实验的条件优化:
(1)LAMP Primer Mix配置
| 浓度 | 引物储液浓度 |
FIP | 16 μM | 100μM |
BIP | 16 μM | 100μM |
Loop F | 8μM | 100μM |
Loop R | 8μM | 100μM |
F3 | 2μM | 100μM |
B3 | 2 μM | 100μM |
(2)四个参数对成功建立LAMP检测方法至关重要,分别是:引物位置;引物使用浓度;反应温度;反应时间。引物使用浓度、反应温度、反应时间是优先要确认的参数,如经过参数调整后仍不能达到检测用标准,则重新设计引物组合,再进行测试。
注意事项:
(1).为了减少交叉污染,请分区操作(试剂和模板DNA的配置操作最好在不同区域中进行)。
(2).各区物品均为专用,不可交叉使用,防止污染。
(3).实验过程中应穿工作服,带手套,建议使用带滤芯的一次性吸嘴。
(4).在LAMP反应结束后禁止将反应管盖打开,否则可能会导致气溶胶污染。一旦发生气溶胶污染,请使用本公司Superbrilliant® DNA气溶胶污染消除剂(ZS-M18005)进行环境清理。